More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1527 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 364 aa  729    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.99 
 
 		 406 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 370 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.03 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.34 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.58 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.9 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.72 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.85 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  41.18 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.84 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.49 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.8 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.67 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 389 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  39.33 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.31 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.56 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  41.06 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.95 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 388 aa  208  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.67 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.33 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.58 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.33 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  38.24 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.55 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.77 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.67 
 
 		 369 aa  205  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  38.85 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.26 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.93 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 386 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.17 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.91 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.65 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.05 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.01 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.16 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39.43 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.83 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.58 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  38.17 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  36.78 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  41.07 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 434 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 434 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  34.91 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.7 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  36.54 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.03 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  36.78 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  46.95 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  36.54 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  44.54 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  39.71 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>