66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0719 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  100 
 
 
134 aa  276  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 
138 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  38.24 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  34.07 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  34.06 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  29.32 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  40.3 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  27.69 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  33.08 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  33.08 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.82 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  35.11 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.62 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  28.91 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.85 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.58 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  33.9 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  26.09 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  28.95 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  27.35 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  30.83 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.24 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.24 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  30.08 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  28.47 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  31.62 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  27.27 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.36 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  30.37 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  27.66 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  27.66 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  29.66 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  29.01 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  28.21 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  25.55 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  22.56 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  26.67 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  25.74 
 
 
132 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  28.97 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  25.93 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  25.64 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  26.28 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  25.44 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  29.66 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  26.62 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  22.45 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  27.42 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  26.47 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.46 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  24.11 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.03 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  27.64 
 
 
143 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  44.68 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  29.55 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  24.14 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  27.21 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>