66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2794 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  766    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  74.22 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  72.12 
 
 		 369 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  71.85 
 
 		 369 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  70.3 
 
 		 369 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  72.19 
 
 		 369 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  70.3 
 
 		 376 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.13 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  47.86 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  51.53 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  48.91 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  43.41 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  40.98 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  45.82 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  40.37 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  46.3 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  46.3 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  46.3 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  46.3 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  46.3 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  44.16 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  43.97 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  44.75 
 
 		 350 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  44.29 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  41.98 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  41.87 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  42.51 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  42.46 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.07 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  39.69 
 
 		 343 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41.06 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  38.91 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  38.91 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  40.67 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.05 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.85 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  39.24 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.73 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  34.81 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  36.9 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  27.15 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  29.86 
 
 		 330 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  29.17 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  30.29 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.71 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  29.92 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  29.28 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  27.31 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  25.09 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  25.65 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  26.57 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  23.98 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  25.83 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  25.46 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.77 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  24.35 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  22.55 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  23.53 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  25.19 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  33.8 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  25 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0946  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1131 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0919  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1131 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  36.11 
 
 		 727 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>