More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2275 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  100 
 
 		 585 aa  1153    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.55 
 
 		 583 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  68.69 
 
 		 583 aa  759    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.46 
 
 		 580 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  65.46 
 
 		 582 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  68.51 
 
 		 583 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  70.29 
 
 		 603 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.36 
 
 		 603 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.75 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.15 
 
 		 613 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.58 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 613 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.53 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.19 
 
 		 626 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 603 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.53 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  47.97 
 
 		 613 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 594 aa  465  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.73 
 
 		 613 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.5 
 
 		 605 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  47.27 
 
 		 606 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.37 
 
 		 633 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  46.83 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.69 
 
 		 613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.26 
 
 		 589 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  42.73 
 
 		 584 aa  452  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  46.5 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  46.18 
 
 		 600 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.95 
 
 		 594 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.78 
 
 		 594 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.57 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.18 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.67 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.04 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.64 
 
 		 611 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
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NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.15 
 
 		 597 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.56 
 
 		 611 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.98 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.96 
 
 		 575 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.35 
 
 		 600 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.39 
 
 		 605 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.64 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.46 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.59 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  40.98 
 
 		 592 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.56 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35 
 
 		 827 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.87 
 
 		 932 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 811 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.68 
 
 		 907 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.71 
 
 		 586 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.34 
 
 		 599 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.02 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.62 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.75 
 
 		 568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.47 
 
 		 798 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.02 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.46 
 
 		 831 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.81 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  36.65 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  32.52 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.01 
 
 		 785 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.55 
 
 		 814 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.54 
 
 		 788 aa  273  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.8 
 
 		 564 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.27 
 
 		 573 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.72 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.76 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.27 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.77 
 
 		 732 aa  268  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.73 
 
 		 977 aa  268  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.91 
 
 		 757 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.91 
 
 		 757 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.7 
 
 		 574 aa  264  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  37.83 
 
 		 566 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.69 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.96 
 
 		 584 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.37 
 
 		 864 aa  263  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.54 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 574 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 571 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.08 
 
 		 989 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.46 
 
 		 1102 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.95 
 
 		 757 aa  260  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.56 
 
 		 580 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.52 
 
 		 574 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.91 
 
 		 885 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  36.82 
 
 		 577 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.23 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.31 
 
 		 568 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.23 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  31.41 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  36.23 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.27 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 567 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.85 
 
 		 570 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.1 
 
 		 574 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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