154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0867 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  100 
 
 		 290 aa  567  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  40.14 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  41.96 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.42 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.01 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  39.34 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  34.55 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  34.55 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.43 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  39.01 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.09 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.97 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  38.7 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  39.79 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  34.24 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.77 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  37.13 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.82 
 
 		 271 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  37.64 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  39.64 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.04 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  36.64 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  36.68 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  34.8 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  34.8 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.9 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  39.93 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  34.8 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  34.38 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  35 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37.82 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  34.64 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  34.02 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  36.82 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  35.93 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  32.19 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.11 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  38.13 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  34.86 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  39.58 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.91 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  32.86 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  37.94 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32.41 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  33.9 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  30.74 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.37 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  38.41 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  32.73 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  35.46 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  37.55 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  32.25 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  35.56 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  35.66 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  35.66 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  34.05 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  36 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  35.27 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  34.8 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  34.75 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  34.75 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  34.75 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  34.75 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  34.75 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  34.75 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  34.75 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>