More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2928 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 431 aa  866    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  49.4 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.26 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 448 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.94 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.15 
 
 		 607 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 		 352 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  26.08 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.92 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  26.7 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 466 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.44 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.35 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.12 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.19 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  25.2 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  31.4 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 372 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.75 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.2 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25.43 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 368 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  24.36 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  25.98 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.37 
 
 		 517 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.86 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 458 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.73 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.71 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.73 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.45 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  23.7 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.95 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.03 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  22.49 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  26.34 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  25.31 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.4 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  25.87 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.5 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>