More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1261 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 707 aa  1463    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 705 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.65 
 
 		 705 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.03 
 
 		 592 aa  673    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.22 
 
 		 705 aa  722    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  49.08 
 
 		 705 aa  719    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  49.36 
 
 		 705 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 705 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.22 
 
 		 705 aa  722    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.36 
 
 		 705 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.94 
 
 		 706 aa  724    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.11 
 
 		 728 aa  835    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 705 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.3 
 
 		 724 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.4 
 
 		 721 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 705 aa  726    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.85 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.39 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.64 
 
 		 593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.12 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 		 718 aa  542  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.75 
 
 		 592 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 		 709 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.72 
 
 		 709 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.58 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.96 
 
 		 731 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 		 714 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.46 
 
 		 626 aa  528  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.75 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 		 674 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 		 715 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.17 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.73 
 
 		 619 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.36 
 
 		 603 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.69 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.98 
 
 		 599 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.72 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.54 
 
 		 707 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.56 
 
 		 615 aa  502  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  43.03 
 
 		 597 aa  501  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.09 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.61 
 
 		 599 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 722 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.71 
 
 		 599 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.02 
 
 		 705 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.13 
 
 		 615 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.72 
 
 		 601 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.25 
 
 		 647 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.61 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 593 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  41.06 
 
 		 621 aa  490  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 593 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.96 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.04 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.2 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.29 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 610 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 610 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 		 601 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  38.36 
 
 		 698 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  40.7 
 
 		 608 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 		 597 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 608 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 719 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 		 612 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  40.54 
 
 		 608 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.43 
 
 		 605 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  41.03 
 
 		 601 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 608 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.33 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 606 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 		 620 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.4 
 
 		 625 aa  479  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  40.03 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.03 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.47 
 
 		 609 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.4 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 		 607 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 609 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 		 610 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 606 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.88 
 
 		 603 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  40.03 
 
 		 609 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 609 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.04 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 		 607 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.06 
 
 		 881 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.35 
 
 		 739 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.32 
 
 		 613 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>