83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0870 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 591 aa  1219    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  38.45 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.1 
 
 		 603 aa  140  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.17 
 
 		 607 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.96 
 
 		 605 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.53 
 
 		 564 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  28.15 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.29 
 
 		 579 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.83 
 
 		 626 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 582 aa  87  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.58 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.08 
 
 		 648 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.54 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.49 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.33 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.75 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.38 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.86 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  20.9 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  21.19 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.18 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  22 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.7 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  20.55 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  22.64 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.04 
 
 		 688 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.26 
 
 		 652 aa  54.7  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.1 
 
 		 616 aa  54.3  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.27 
 
 		 780 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  26.42 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  23.03 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  36.62 
 
 		 641 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.98 
 
 		 574 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.42 
 
 		 689 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  25.49 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.56 
 
 		 615 aa  50.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.05 
 
 		 674 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  36.78 
 
 		 650 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  23.5 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  35.44 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  25.23 
 
 		 771 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  24.16 
 
 		 505 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  21.97 
 
 		 628 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 647 aa  47.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  31.65 
 
 		 708 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.98 
 
 		 634 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.06 
 
 		 708 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.93 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  29.63 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  21.7 
 
 		 610 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  37.25 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.37 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  38.71 
 
 		 600 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  33.63 
 
 		 697 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  45.65 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.85 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.93 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  48.78 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 604 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.92 
 
 		 677 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.92 
 
 		 677 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.36 
 
 		 594 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  43.48 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  42.5 
 
 		 565 aa  43.9  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  51.35 
 
 		 307 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  32.1 
 
 		 399 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>