More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1454 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  97.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 142 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 142 aa  94  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  29.23 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  84.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.93 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  42.27 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  42.42 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  39.22 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  40.91 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  40.19 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.15 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  40.21 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.87 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  43.82 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.62 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  38.95 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.2 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  39.33 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>