More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4725 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 433 aa  881    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  33.66 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  32.96 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  33.51 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  30.67 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  33.75 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  30.85 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  32.13 
 
 		 423 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 		 793 aa  160  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  30.85 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  33.22 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  31.42 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  28.35 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  27.4 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 312 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  30.25 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  31.25 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.82 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  27.82 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.57 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  27.82 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.57 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.78 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  27.82 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  27.82 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  27.82 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 		 647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.95 
 
 		 1115 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  29.84 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.28 
 
 		 1115 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.28 
 
 		 1119 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.95 
 
 		 1115 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.98 
 
 		 1115 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  27.8 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.21 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  28.73 
 
 		 688 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  25.42 
 
 		 579 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  23.29 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 1124 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.95 
 
 		 927 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  44.26 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  27.15 
 
 		 542 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 583 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 567 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  27.63 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  27.59 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.11 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 1101 aa  90.5  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 1118 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.34 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 1154 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  54.69 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 77 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  57.38 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  59.68 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 974 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 1120 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60.94 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  55.56 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  46.34 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  51.52 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  40.2 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  51.39 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  54.69 
 
 		 229 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 321 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  53.57 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  19.87 
 
 		 1002 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  53.33 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.84 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  43.84 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.77 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  52.17 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  51.61 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  51.61 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.77 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  34.43 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.61 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.12 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  62.22 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  23.01 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  50.85 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  49.21 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.83 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.66 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.56 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.83 
 
 		 872 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>