261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2685 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  769    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
401 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  26.35 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  26.88 
 
 
385 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.39 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.33 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  26.05 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  24.06 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.91 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.9 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.84 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  24.28 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.84 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  24.16 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  27.17 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  23.43 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  36.13 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 
485 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 
472 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  26.28 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 
592 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  25 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.97 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
465 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  25.97 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
491 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.69 
 
 
613 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 
489 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
491 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
579 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  26.67 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  26.67 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  26.67 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.59 
 
 
599 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 
579 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
510 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  25.97 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 
462 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.59 
 
 
599 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.37 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  23.92 
 
 
358 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.37 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 
487 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 
599 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  26.45 
 
 
542 aa  53.5  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.65 
 
 
474 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 
643 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 
643 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
597 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 
505 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 
526 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 
607 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.13 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  25.85 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
445 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3403  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
513 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000797372  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 
537 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 
491 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  26.11 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.02 
 
 
509 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  24.18 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  29.86 
 
 
571 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 
478 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.39 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
523 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  27.33 
 
 
535 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 
503 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  40 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  20.46 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  25.75 
 
 
539 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
243 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 
508 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
530 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  26.43 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 
565 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>