156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0581 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0581  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  306  9e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.64 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  32.69 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.9 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  35.2 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  35.19 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  35.19 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  29.81 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  32.21 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.84 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  35.54 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  36.13 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  32.8 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.62 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  28.81 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  36.67 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  31.09 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  34.26 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  32.52 
 
 
227 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  34.45 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  38.52 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  37.5 
 
 
209 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  33.9 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  36.13 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  30.4 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  35.29 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  32.73 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  34.17 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  34.17 
 
 
429 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  35.64 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  36.27 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  26.05 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  37.1 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2589  hypothetical protein  31.62 
 
 
195 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.436123  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31000  hypothetical protein  38.84 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.188016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39260  hypothetical protein  29.63 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  29.22 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  32.71 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  34.58 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.96 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  32.48 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  36.61 
 
 
324 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  27.12 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  29.66 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  37.7 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  30.17 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  33.9 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  33.63 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  33.91 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  38.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  38.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  33.91 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  36.29 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  32.74 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  35.16 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  29.84 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  30.19 
 
 
148 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  30.19 
 
 
148 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.83 
 
 
167 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.22 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  33.66 
 
 
156 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  33.66 
 
 
156 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.13 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  34.86 
 
 
142 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  35.64 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  35.48 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  29.82 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  33.01 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  29.84 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2016  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2165  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  27.52 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  30.43 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  28.12 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  30.84 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  29.81 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.8 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  34.45 
 
 
323 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  33.1 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>