More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5557 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  63.86 
 
 		 529 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  100 
 
 		 529 aa  1090    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  62.95 
 
 		 530 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  62.19 
 
 		 529 aa  695    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  73.48 
 
 		 528 aa  813    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  41.7 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  35.17 
 
 		 541 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  33.14 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 536 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 544 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  34.35 
 
 		 537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  34.35 
 
 		 537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  34.35 
 
 		 537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  32.58 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  34.16 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  33.46 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  32.89 
 
 		 541 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  34.77 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  32.45 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  32.95 
 
 		 565 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  33.27 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  34.24 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  32.89 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  33.09 
 
 		 534 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  32.95 
 
 		 532 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  31.89 
 
 		 545 aa  257  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  32.7 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.66 
 
 		 536 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  32.7 
 
 		 555 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  34.35 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  33.52 
 
 		 534 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  30.13 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.32 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  32.63 
 
 		 527 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 520 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 511 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  31.05 
 
 		 535 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 548 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  29.64 
 
 		 539 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  31.25 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  29.68 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  32.31 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 548 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.42 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  30.42 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 530 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  29.37 
 
 		 551 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  29.37 
 
 		 551 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  32.3 
 
 		 635 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 652 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  27.45 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  30.38 
 
 		 525 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.16 
 
 		 645 aa  209  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  31.82 
 
 		 535 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  31.16 
 
 		 540 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  27.74 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  31.84 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.7 
 
 		 548 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.2 
 
 		 639 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 629 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.35 
 
 		 644 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.41 
 
 		 638 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  29.85 
 
 		 531 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  31.34 
 
 		 540 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 		 636 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  29.76 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  29.03 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  30.06 
 
 		 643 aa  201  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  31.49 
 
 		 644 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.07 
 
 		 634 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  32.29 
 
 		 639 aa  200  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  30.6 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  31.42 
 
 		 633 aa  199  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.83 
 
 		 636 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  31.16 
 
 		 540 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.4 
 
 		 643 aa  199  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.96 
 
 		 634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  30.38 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  29.6 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  31.52 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  29.03 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  29.94 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  30.86 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  30.63 
 
 		 523 aa  198  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  30.81 
 
 		 631 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  31.01 
 
 		 641 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 540 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  29.21 
 
 		 544 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>