87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5409 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 		 468 aa  965    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  32.98 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  42.81 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  39.64 
 
 		 255 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  35.02 
 
 		 417 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  37.55 
 
 		 417 aa  156  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  37.97 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  33.7 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  34.12 
 
 		 218 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  36.96 
 
 		 264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  31.87 
 
 		 253 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 268 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  32.89 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  29.54 
 
 		 277 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  30.53 
 
 		 886 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  31.05 
 
 		 217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  32.02 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  29.71 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  34.58 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  32.7 
 
 		 243 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  33.49 
 
 		 260 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  29.13 
 
 		 245 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 237 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  29.8 
 
 		 265 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.89 
 
 		 261 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.19 
 
 		 563 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  33.17 
 
 		 2334 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.95 
 
 		 1771 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.57 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  25.81 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  26.83 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  29.13 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  28.77 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  23.68 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.61 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  23.5 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  23.5 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.65 
 
 		 824 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  25.84 
 
 		 777 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.83 
 
 		 644 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.97 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  25.74 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  31.29 
 
 		 656 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  36.76 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 		 845 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.59 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.95 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 		 228 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.74 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  26.49 
 
 		 235 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.46 
 
 		 729 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.39 
 
 		 645 aa  46.6  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.2 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  29.05 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  27.75 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.29 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.31 
 
 		 724 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 		 795 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  24.16 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35564  predicted protein  27.18 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  23.77 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  25.17 
 
 		 796 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.37 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.84 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.39 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.62 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.99 
 
 		 686 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 		 689 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.58 
 
 		 667 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  23.18 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.08 
 
 		 634 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.36 
 
 		 739 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  32.56 
 
 		 162 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  26.42 
 
 		 700 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0541  putative esterase  32.65 
 
 		 210 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  27.83 
 
 		 232 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  29.38 
 
 		 280 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  21.37 
 
 		 245 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.53 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.53 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.53 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  24.38 
 
 		 665 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  30.43 
 
 		 341 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.64 
 
 		 791 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>