More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4700 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 372 aa  780    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  51.64 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  47.06 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  48.53 
 
 		 377 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  46.51 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  45.45 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  27.53 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.38 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.77 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  21.74 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.68 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  33.01 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.89 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.89 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  25.4 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  19.95 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  26.63 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  24.55 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  30.25 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  25.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  22.15 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  21.12 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  21.45 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  24.34 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.37 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.18 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  26.83 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  22.36 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  29.03 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>