182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4679 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  63.31 
 
 		 358 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  46.37 
 
 		 359 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  46.78 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  40.56 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  36.29 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  36.24 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  34.17 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  33.99 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  32.77 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  28.37 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  28.33 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.84 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.6 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 792 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.93 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  19.83 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.95 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.56 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  23.42 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 1111 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.09 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 1061 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.78 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 1061 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  19.67 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 1040 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.51 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.54 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 1096 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  25.13 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.92 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  19.74 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.16 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  23.65 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  21.7 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  21.9 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  20.6 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  21.53 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  23.02 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  20.42 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  33.6 
 
 		 495 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.22 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  21.53 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 1153 aa  56.2  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.74 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.84 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  21.81 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.73 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  21.72 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  18.9 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.08 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.05 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  21.35 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>