More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1222 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  36.16 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  37.18 
 
 		 261 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  33.61 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  34.05 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  30.45 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  28.9 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  23.89 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.3 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.21 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.8 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  30.94 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  31.53 
 
 		 276 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.75 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.53 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.15 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.51 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  30.1 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.69 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.87 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.9 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>