More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1876 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  100 
 
 		 979 aa  1992    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  34.8 
 
 		 955 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  34.89 
 
 		 940 aa  492  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.4 
 
 		 1284 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.76 
 
 		 1331 aa  379  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1326 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.93 
 
 		 1763 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1310 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 1340 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1267 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 1765 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.46 
 
 		 2213 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1611 aa  361  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1767 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1767 aa  360  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 1165 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.99 
 
 		 1765 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.45 
 
 		 1574 aa  355  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1767 aa  354  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1582 aa  351  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 1768 aa  346  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1771 aa  346  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 957 aa  343  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 		 1005 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 1548 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 916 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.76 
 
 		 2035 aa  340  7e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.25 
 
 		 1683 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 1782 aa  337  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 981 aa  337  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1784 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1622 aa  336  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1786 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 929 aa  335  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 1792 aa  333  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1234 aa  332  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 1128 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  41.81 
 
 		 1417 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 		 1626 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1397 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1033 aa  327  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 1303 aa  327  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 1245 aa  327  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  38.21 
 
 		 1200 aa  327  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1603 aa  326  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1245 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1234 aa  326  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1560 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  41.43 
 
 		 1418 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1236 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 2654 aa  321  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 		 1236 aa  320  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  38.02 
 
 		 1188 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  38.96 
 
 		 1439 aa  320  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1230 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 920 aa  320  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1333 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1236 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1236 aa  320  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1363 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  37.8 
 
 		 1364 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1659 aa  318  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1238 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1238 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1238 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1238 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1632 aa  317  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 1275 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  38.07 
 
 		 1236 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.42 
 
 		 847 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1788 aa  314  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 833 aa  314  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.41 
 
 		 852 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  39.07 
 
 		 1030 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 1166 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1629 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1629 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 1245 aa  310  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 812 aa  310  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1625 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  37.1 
 
 		 861 aa  310  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1240 aa  308  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.41 
 
 		 1653 aa  308  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1040 aa  308  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  38.01 
 
 		 680 aa  307  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.51 
 
 		 1407 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.45 
 
 		 1053 aa  304  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.7 
 
 		 1468 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.68 
 
 		 1177 aa  304  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 950 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.77 
 
 		 923 aa  303  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.73 
 
 		 977 aa  303  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 925 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1009 aa  303  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.67 
 
 		 1442 aa  302  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1021 aa  301  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.61 
 
 		 1014 aa  302  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1069 aa  301  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1203 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>