More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0597 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
360 aa  736    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  71.1 
 
 
352 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  69.45 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 
363 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  36.05 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  39.66 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  38.75 
 
 
358 aa  200  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  40.57 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  39.26 
 
 
349 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  38.51 
 
 
349 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.73 
 
 
468 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.83 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.82 
 
 
466 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  29.24 
 
 
473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.83 
 
 
457 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.97 
 
 
463 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  32.74 
 
 
464 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  30.77 
 
 
1150 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.76 
 
 
476 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.52 
 
 
503 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.92 
 
 
466 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  33.14 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  31.96 
 
 
480 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  29.75 
 
 
480 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  31.36 
 
 
455 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  29.74 
 
 
469 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  30.95 
 
 
476 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  29.79 
 
 
468 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.03 
 
 
699 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.38 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  30.38 
 
 
469 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  30.75 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  30.06 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  30.5 
 
 
477 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  31.01 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
480 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36 
 
 
1105 aa  140  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  28.95 
 
 
462 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.55 
 
 
476 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.29 
 
 
761 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  30.26 
 
 
688 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
469 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  30.7 
 
 
476 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.67 
 
 
465 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.38 
 
 
464 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.92 
 
 
1424 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  30.47 
 
 
470 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  29.59 
 
 
482 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.14 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.43 
 
 
1126 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  29.45 
 
 
472 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  29.45 
 
 
472 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  29.45 
 
 
472 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  31.22 
 
 
513 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  29.15 
 
 
472 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.38 
 
 
464 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  30.38 
 
 
467 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.26 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 
1432 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  30.79 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  29.33 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  28.41 
 
 
473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  30.94 
 
 
513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.27 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 
483 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 
472 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.43 
 
 
447 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  30.14 
 
 
485 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  27.86 
 
 
472 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  32.28 
 
 
469 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.36 
 
 
467 aa  133  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 
1432 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.87 
 
 
483 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  28.45 
 
 
472 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  27.27 
 
 
472 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.59 
 
 
609 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.23 
 
 
1487 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.74 
 
 
612 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  27.86 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.14 
 
 
457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.57 
 
 
667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
465 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  31.73 
 
 
994 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.83 
 
 
1432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.33 
 
 
663 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.37 
 
 
654 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0530  glutamate synthase, small subunit  29.03 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0212146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.91 
 
 
1410 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  31.71 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0331  putative oxidoreductase  31.86 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.51 
 
 
1428 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.06 
 
 
469 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  29.11 
 
 
482 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  30.18 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  30.45 
 
 
493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  30.03 
 
 
747 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.95 
 
 
658 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>