More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1521 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
352 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  79.72 
 
 
363 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  77.71 
 
 
352 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  71.1 
 
 
360 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  42.69 
 
 
352 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  40.18 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  40.4 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  41.03 
 
 
349 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  40.86 
 
 
349 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  37.8 
 
 
331 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.93 
 
 
468 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.33 
 
 
468 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.62 
 
 
464 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.01 
 
 
466 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.14 
 
 
699 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.63 
 
 
457 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  34.91 
 
 
468 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  33.53 
 
 
688 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.53 
 
 
1126 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  31.2 
 
 
462 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.47 
 
 
463 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.23 
 
 
476 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  34.12 
 
 
469 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.12 
 
 
463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.14 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  34 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  30.41 
 
 
472 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  28.95 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  32.07 
 
 
469 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.23 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.47 
 
 
474 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  29.45 
 
 
473 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.75 
 
 
464 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  30.41 
 
 
472 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  30.41 
 
 
472 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  32.3 
 
 
471 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  30.09 
 
 
472 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  30.41 
 
 
472 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  29.12 
 
 
472 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  30.88 
 
 
472 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.24 
 
 
465 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  32.05 
 
 
469 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  30.52 
 
 
480 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  30.29 
 
 
472 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  30.29 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  30.29 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.53 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  30.61 
 
 
477 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.54 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  29.71 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  29.79 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.73 
 
 
1426 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
455 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  30.68 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  29.12 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.1 
 
 
483 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  30.03 
 
 
482 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
476 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  30.26 
 
 
1150 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  28.82 
 
 
477 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  32.15 
 
 
470 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.55 
 
 
465 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  33.63 
 
 
476 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  31.34 
 
 
493 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.98 
 
 
658 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  30.79 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  30.9 
 
 
483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 
1410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  29.45 
 
 
1387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  29.74 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  32.25 
 
 
467 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  31.12 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.75 
 
 
1424 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  34.33 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.31 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36 
 
 
1105 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.84 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.23 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  32.36 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.75 
 
 
1440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  29.53 
 
 
480 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  29.74 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  31.86 
 
 
465 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 
1440 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.43 
 
 
1008 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.72 
 
 
994 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.79 
 
 
996 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.74 
 
 
1425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.55 
 
 
1011 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.68 
 
 
1432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.55 
 
 
1011 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.82 
 
 
1432 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.59 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.17 
 
 
1425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  29.45 
 
 
1412 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 
1421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.75 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  30.32 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.23 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>