More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2086 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 352 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  77.71 
 
 		 352 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  74.01 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  69.45 
 
 		 360 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  40.18 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  39.76 
 
 		 349 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  40.24 
 
 		 349 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  37.39 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  40.36 
 
 		 352 aa  196  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  39.47 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.63 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  35.33 
 
 		 468 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.28 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.71 
 
 		 466 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.43 
 
 		 464 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.5 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.62 
 
 		 466 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.03 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.07 
 
 		 476 aa  149  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  31.12 
 
 		 469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  30.81 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  33.24 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  30.72 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 455 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  29.25 
 
 		 1150 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  32.36 
 
 		 482 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  31.78 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  28.9 
 
 		 472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 503 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  31.59 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  31.58 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  32.05 
 
 		 469 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.75 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  31.95 
 
 		 468 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  30.61 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  30.59 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  31.67 
 
 		 476 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.85 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.64 
 
 		 483 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.48 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  30 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  28.82 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  30 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  29.56 
 
 		 493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  29.2 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  28.49 
 
 		 472 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  28.24 
 
 		 473 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  30.95 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  32.14 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  27.62 
 
 		 472 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.25 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.33 
 
 		 463 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.34 
 
 		 464 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  27.91 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.42 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.23 
 
 		 699 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.53 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  29.19 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.38 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  27.91 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  32.07 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  28.32 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  29.19 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  28.32 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  29.19 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  27.76 
 
 		 473 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.16 
 
 		 464 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  32.26 
 
 		 688 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  28.99 
 
 		 481 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.76 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  28.03 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.07 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  27.33 
 
 		 472 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.73 
 
 		 653 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.63 
 
 		 658 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  28.32 
 
 		 468 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  28.61 
 
 		 472 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  28.9 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.17 
 
 		 612 aa  132  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  29.2 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  30.97 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.55 
 
 		 1105 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  28.03 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.72 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.16 
 
 		 654 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  32.95 
 
 		 481 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.37 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  32.65 
 
 		 476 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  30.14 
 
 		 513 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.06 
 
 		 761 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  31.01 
 
 		 465 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.67 
 
 		 1487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  29.86 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.49 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>