More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0612 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 358 aa  731    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  55.71 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  54.6 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  56 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  55.71 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  41.19 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  41.79 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  40.18 
 
 		 352 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  38.87 
 
 		 468 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  40.18 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  38.75 
 
 		 360 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  37.69 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.97 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.71 
 
 		 466 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.39 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.54 
 
 		 463 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.5 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.69 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  36.75 
 
 		 470 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.28 
 
 		 467 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.6 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.3 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.9 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  33.73 
 
 		 1150 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.67 
 
 		 761 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  35.23 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  35.23 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  34.94 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  35.23 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  34.09 
 
 		 473 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.02 
 
 		 464 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.44 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.33 
 
 		 469 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.73 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.61 
 
 		 658 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.95 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.93 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.01 
 
 		 469 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 1426 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.23 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.83 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  33.33 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  34.08 
 
 		 493 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  34.19 
 
 		 472 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  32.87 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  33.05 
 
 		 477 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  34.44 
 
 		 471 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  32.48 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.63 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  34.38 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.14 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  34.12 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.05 
 
 		 653 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.13 
 
 		 447 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  32.93 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  33.72 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  34.01 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.44 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.43 
 
 		 483 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  32.87 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  33.71 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.14 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.93 
 
 		 480 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  33.04 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  34.13 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  34.23 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.63 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.91 
 
 		 663 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  32.44 
 
 		 480 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  33.63 
 
 		 1387 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.36 
 
 		 448 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  32.74 
 
 		 480 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.17 
 
 		 659 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  33.72 
 
 		 468 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  34.73 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  34.73 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 		 1126 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.93 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.32 
 
 		 654 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.3 
 
 		 1440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.2 
 
 		 659 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  36.12 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.63 
 
 		 477 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.22 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.34 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.2 
 
 		 659 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.69 
 
 		 653 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.44 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  33.97 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.2 
 
 		 659 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.91 
 
 		 659 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  33.91 
 
 		 659 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  33.13 
 
 		 1412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  33.84 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.45 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.91 
 
 		 659 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  32.28 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>