More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1766 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 331 aa  668    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  45.4 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  44.25 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  45.8 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  43.87 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  41.19 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  36.92 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  36.05 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  37.39 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  37.8 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  38.12 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  35.29 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 		 472 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  36.09 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  36.09 
 
 		 472 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  35.19 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 		 472 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  36.09 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  35.49 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  35.49 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  35.49 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  39.02 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  35.78 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  37.19 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  35.08 
 
 		 473 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  34.88 
 
 		 472 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  35.78 
 
 		 472 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  34.37 
 
 		 472 aa  185  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  35.17 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  35.17 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  34.26 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  35.17 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  35.17 
 
 		 472 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  35.29 
 
 		 468 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  34.88 
 
 		 472 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  35.17 
 
 		 472 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  35.47 
 
 		 472 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.52 
 
 		 476 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  34.26 
 
 		 472 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  33.94 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  33.75 
 
 		 483 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.64 
 
 		 474 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  35.28 
 
 		 503 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  34.27 
 
 		 467 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  36.14 
 
 		 477 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  34.97 
 
 		 472 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  34.26 
 
 		 472 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  34.36 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  33.02 
 
 		 469 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.77 
 
 		 470 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  32.82 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  34.36 
 
 		 472 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  34.36 
 
 		 472 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  35.06 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  32.82 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  35.28 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  35.28 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  33.64 
 
 		 472 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.64 
 
 		 470 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.91 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  35.09 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.8 
 
 		 658 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  34.25 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  34.36 
 
 		 472 aa  175  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  37.35 
 
 		 469 aa  175  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  34.05 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  35.15 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  35.89 
 
 		 480 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.95 
 
 		 468 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  33.94 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.67 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.64 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  35.69 
 
 		 480 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  34.88 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  34.47 
 
 		 468 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.16 
 
 		 465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  34.47 
 
 		 468 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.31 
 
 		 466 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.84 
 
 		 457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.88 
 
 		 467 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.96 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  33.13 
 
 		 480 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.64 
 
 		 483 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.42 
 
 		 463 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.63 
 
 		 469 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  34.85 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  33.84 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.04 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.98 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.95 
 
 		 761 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.95 
 
 		 659 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  33.85 
 
 		 468 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.64 
 
 		 659 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  33.23 
 
 		 468 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  33.23 
 
 		 468 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  35.56 
 
 		 483 aa  169  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  32.82 
 
 		 472 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>