More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1365 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1365  putative glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 349 aa  694    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0421647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1108  putative glutamate synthase subunit beta  88.22 
 
 		 352 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0400  putative glutamate synthase subunit beta  85.92 
 
 		 349 aa  591  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.354611  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1728  putative glutamate synthase subunit beta  81.32 
 
 		 349 aa  567  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000274532 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0612  putative glutamate synthase subunit beta  56 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1766  putative glutamate synthase subunit beta  45.8 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0996578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  41.49 
 
 		 468 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  41.19 
 
 		 468 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0597  putative glutamate synthase subunit beta  40.57 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0446  putative glutamate synthase subunit beta  40.36 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.31 
 
 		 476 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1521  putative glutamate synthase subunit beta  41.03 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  39.88 
 
 		 463 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.3 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  38.04 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2086  putative glutamate synthase subunit beta  39.47 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.282601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.24 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.57 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.46 
 
 		 466 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.19 
 
 		 466 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.18 
 
 		 465 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.89 
 
 		 463 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  37.18 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  41.89 
 
 		 469 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  38.95 
 
 		 482 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  38.01 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  38.99 
 
 		 455 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.6 
 
 		 469 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.83 
 
 		 474 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  39.71 
 
 		 483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  38.24 
 
 		 464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.24 
 
 		 658 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  37.5 
 
 		 493 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.76 
 
 		 480 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  40 
 
 		 480 aa  195  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  37.86 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  38.89 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  37.96 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  37.11 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  38.08 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  36.72 
 
 		 473 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  37.83 
 
 		 469 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  38.14 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  38.14 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  38.14 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  36.76 
 
 		 462 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  34.91 
 
 		 1150 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  36.54 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  37.29 
 
 		 472 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  37.68 
 
 		 472 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 1426 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  36.83 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  38.08 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  36.98 
 
 		 467 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  36.83 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  36.54 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  37.76 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  37.11 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.22 
 
 		 469 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  37.39 
 
 		 472 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  37.83 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  37.79 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.62 
 
 		 467 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.21 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  38.12 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.82 
 
 		 761 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  38.12 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  37.11 
 
 		 473 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  36.66 
 
 		 469 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.8 
 
 		 467 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 		 469 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.7 
 
 		 458 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.4 
 
 		 470 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.96 
 
 		 464 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.59 
 
 		 479 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.1 
 
 		 663 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.34 
 
 		 996 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.12 
 
 		 653 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  35.54 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.69 
 
 		 1073 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.31 
 
 		 465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  35.99 
 
 		 469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  36.16 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.84 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.16 
 
 		 483 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.59 
 
 		 497 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.2 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35.99 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.63 
 
 		 477 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  35.59 
 
 		 470 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.06 
 
 		 659 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.96 
 
 		 1410 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.76 
 
 		 659 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  34.75 
 
 		 475 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  38.57 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.34 
 
 		 653 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.34 
 
 		 653 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  35.26 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  34.11 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>