More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1986 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  921    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  45.49 
 
 		 776 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.43 
 
 		 455 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  36.78 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  35.49 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  36.92 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  37 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  37.75 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  34.77 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 727 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  33.19 
 
 		 486 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  34.76 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 447 aa  249  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.88 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.91 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.39 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  35.31 
 
 		 467 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 471 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  36.42 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 441 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  34.86 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  32.34 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  30.56 
 
 		 561 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 581 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 579 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 573 aa  209  9e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 582 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 		 543 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  27.77 
 
 		 559 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 		 588 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  32.65 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 608 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  32.26 
 
 		 706 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.66 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.93 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 		 341 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.39 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  36.51 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25.85 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.54 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.26 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.55 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.17 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.98 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.43 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.28 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.29 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.6 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.36 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002954  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.43 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1512  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.18 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.59 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>