More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3159 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  100 
 
 		 420 aa  844    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  62.04 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  58.35 
 
 		 421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  58.6 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  58.35 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  58.6 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  58.6 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  58.6 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.84 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  58.35 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  58.35 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.11 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  57.87 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.35 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  58.35 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.11 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.35 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  57.14 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  58.65 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  58.94 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  58.94 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  57.49 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  56.31 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  56.9 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.42 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  57.52 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  53.11 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.93 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  54.82 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.46 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.74 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.95 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.21 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  55.21 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.96 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  51.22 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.09 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  54.22 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.55 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  53.35 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  53.19 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  46.1 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.95 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.28 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  41.95 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  44.15 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.99 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.37 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  40.76 
 
 		 434 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.43 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.35 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.41 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  38.81 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.32 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  36.98 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.04 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.9 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  42.24 
 
 		 451 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  38.46 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.51 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.95 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  42.04 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.86 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  37.59 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.95 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.28 
 
 		 437 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.52 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  40.24 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  42.02 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  37.91 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  40.4 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.29 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.91 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  36.19 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  33.26 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  39.86 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  36.45 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.07 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  36.38 
 
 		 429 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  35.24 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  40.69 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  35.05 
 
 		 429 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.05 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.93 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.05 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  38.87 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.09 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.72 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  36.9 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.37 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  37.58 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  32.85 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  33.86 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.33 
 
 		 451 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  35.7 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.09 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  34.94 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  35.91 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  37.01 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>