More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1176 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 429 aa  837    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  39.9 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  35.15 
 
 		 489 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  34.46 
 
 		 445 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  35.33 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  30.1 
 
 		 479 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  31.9 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 442 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  30.19 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  30.19 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.19 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.33 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.76 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  30.75 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  30.75 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  30.75 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  30.75 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  30.75 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  30.75 
 
 		 443 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  31.02 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  30.48 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  27.98 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.06 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.09 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  27.72 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.59 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.15 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.86 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.07 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  27.6 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  29.1 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.93 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.31 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.7 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.3 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  29.15 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  24.01 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.77 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.74 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.13 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.65 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  27.37 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.8 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.87 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  29.54 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.61 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.61 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.01 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.12 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.4 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  26.23 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.29 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.3 
 
 		 533 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.27 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 449 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>