60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4084 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1251 aa  2471    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  34.1 
 
 		 1063 aa  164  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  36.7 
 
 		 1343 aa  154  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  35.58 
 
 		 1318 aa  148  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  36.06 
 
 		 1366 aa  147  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  36.36 
 
 		 513 aa  142  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  31.95 
 
 		 1075 aa  141  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  34.15 
 
 		 1031 aa  141  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  34.15 
 
 		 1031 aa  141  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  31.09 
 
 		 1161 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  30.31 
 
 		 1095 aa  139  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  34.11 
 
 		 1028 aa  138  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  34.11 
 
 		 1028 aa  138  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  29.68 
 
 		 1021 aa  138  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  33.33 
 
 		 1028 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  33.33 
 
 		 530 aa  135  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  33.45 
 
 		 1080 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  33.45 
 
 		 1080 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  33.45 
 
 		 1080 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  33.45 
 
 		 1080 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1366 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  30 
 
 		 1380 aa  123  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1354 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  33.85 
 
 		 1056 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  34.03 
 
 		 1282 aa  106  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  33.65 
 
 		 1222 aa  104  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 612 aa  102  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  36.36 
 
 		 611 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  36.26 
 
 		 908 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  30.74 
 
 		 1644 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  32.41 
 
 		 1451 aa  94  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  28.29 
 
 		 991 aa  90.9  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  29.64 
 
 		 921 aa  89.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  30.43 
 
 		 938 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  34.1 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  28.24 
 
 		 1104 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  34 
 
 		 671 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  26.5 
 
 		 915 aa  83.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  29.43 
 
 		 1137 aa  82.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  29.43 
 
 		 1137 aa  82.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  32.46 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  36.07 
 
 		 1122 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  26.34 
 
 		 957 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  34.04 
 
 		 914 aa  77  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  30.37 
 
 		 611 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  30.73 
 
 		 706 aa  73.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1006 aa  60.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  36.57 
 
 		 222 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  35.19 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  25.61 
 
 		 936 aa  55.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.86 
 
 		 192 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  37.78 
 
 		 1521 aa  52.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  32.26 
 
 		 216 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  35.09 
 
 		 217 aa  49.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  57.89 
 
 		 222 aa  48.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  31.45 
 
 		 206 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  31.71 
 
 		 219 aa  47.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  22.42 
 
 		 924 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  27.56 
 
 		 1167 aa  45.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  33.65 
 
 		 205 aa  45.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>