More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3765 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4868  phosphogluconate dehydratase  59.7 
 
 		 612 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2072  phosphogluconate dehydratase  55.79 
 
 		 608 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.013535  normal  0.010914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2007  phosphogluconate dehydratase  58.31 
 
 		 609 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.691716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1010  phosphogluconate dehydratase  57.5 
 
 		 608 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1018  phosphogluconate dehydratase  59.23 
 
 		 619 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1440  phosphogluconate dehydratase  59.17 
 
 		 608 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0037  phosphogluconate dehydratase  59.9 
 
 		 609 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1560  phosphogluconate dehydratase  60.2 
 
 		 609 aa  713    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0466  phosphogluconate dehydratase  59.07 
 
 		 604 aa  699    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2283  phosphogluconate dehydratase  54.08 
 
 		 604 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.348239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2537  phosphogluconate dehydratase  56.69 
 
 		 608 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2487  phosphogluconate dehydratase  57.57 
 
 		 608 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1288  6-phosphogluconate dehydratase  55.52 
 
 		 608 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0335  phosphogluconate dehydratase  56.31 
 
 		 630 aa  660    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1934  phosphogluconate dehydratase  61.09 
 
 		 608 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3765  phosphogluconate dehydratase  100 
 
 		 608 aa  1232    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345998 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2446  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3370  phosphogluconate dehydratase  59.14 
 
 		 634 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.188848  hitchhiker  0.0000000960322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0461  phosphogluconate dehydratase  51.66 
 
 		 612 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1109  phosphogluconate dehydratase  55.68 
 
 		 608 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0581  phosphogluconate dehydratase  61.35 
 
 		 618 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.600403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7021  phosphogluconate dehydratase  55.68 
 
 		 610 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1081  phosphogluconate dehydratase  62.81 
 
 		 623 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5330  phosphogluconate dehydratase  59.41 
 
 		 611 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388356  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4525  phosphogluconate dehydratase  56.46 
 
 		 608 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4499  phosphogluconate dehydratase  55.39 
 
 		 604 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3428  phosphogluconate dehydratase  57.94 
 
 		 608 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280637 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3442  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4375  phosphogluconate dehydratase  56.01 
 
 		 608 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1181  phosphogluconate dehydratase  57.26 
 
 		 601 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3746  phosphogluconate dehydratase  61.35 
 
 		 618 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3407  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1727  phosphogluconate dehydratase  58.92 
 
 		 606 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1624  phosphogluconate dehydratase  58.92 
 
 		 606 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0371  phosphogluconate dehydratase  55.98 
 
 		 638 aa  659    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2333  phosphogluconate dehydratase  56.62 
 
 		 608 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.480587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2132  phosphogluconate dehydratase  56.29 
 
 		 608 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0124289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1312  phosphogluconate dehydratase  58.28 
 
 		 607 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.19652  normal  0.978584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2868  phosphogluconate dehydratase  56.34 
 
 		 613 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1791  phosphogluconate dehydratase  52.89 
 
 		 623 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.563758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1217  phosphogluconate dehydratase  60.86 
 
 		 617 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.890922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1698  phosphogluconate dehydratase  59.07 
 
 		 617 aa  701    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.390811  hitchhiker  0.0000236515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1895  phosphogluconate dehydratase  60.17 
 
 		 606 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.488647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1953  phosphogluconate dehydratase  56.81 
 
 		 601 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0750958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2060  phosphogluconate dehydratase  76.18 
 
 		 616 aa  933    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1381  phosphogluconate dehydratase  54.71 
 
 		 609 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0759  phosphogluconate dehydratase  68.9 
 
 		 624 aa  865    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0364344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1476  phosphogluconate dehydratase  52.89 
 
 		 623 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3551  phosphogluconate dehydratase  74.63 
 
 		 605 aa  926    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.952112  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0589  phosphogluconate dehydratase  59.87 
 
 		 634 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2077  phosphogluconate dehydratase  56.07 
 
 		 608 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0936  phosphogluconate dehydratase  58.51 
 
 		 623 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1045  phosphogluconate dehydratase  63.04 
 
 		 629 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00269183  normal  0.140285 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5802  phosphogluconate dehydratase  58.64 
 
 		 700 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00611  phosphogluconate dehydratase  55.3 
 
 		 638 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0376  phosphogluconate dehydratase  56.44 
 
 		 603 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0191  phosphogluconate dehydratase  59.87 
 
 		 663 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.970836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0177  phosphogluconate dehydratase  61.18 
 
 		 618 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0627  phosphogluconate dehydratase  61.18 
 
 		 618 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0972  phosphogluconate dehydratase  55.54 
 
 		 607 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.798865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0157  phosphogluconate dehydratase  57.07 
 
 		 604 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0730  phosphogluconate dehydratase  58.03 
 
 		 576 aa  658    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2044  phosphogluconate dehydratase  57.07 
 
 		 608 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.747422  normal  0.183886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1931  phosphogluconate dehydratase  57.4 
 
 		 608 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0231353  normal  0.168183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1894  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 608 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1582  phosphogluconate dehydratase  53.48 
 
 		 618 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2640  phosphogluconate dehydratase  61.86 
 
 		 618 aa  683    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0555  phosphogluconate dehydratase  61.18 
 
 		 618 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1303  phosphogluconate dehydratase  57.76 
 
 		 601 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22910  phosphogluconate dehydratase  61.42 
 
 		 608 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.404341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2723  phosphogluconate dehydratase  61.18 
 
 		 618 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3524  phosphogluconate dehydratase  59.76 
 
 		 616 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0350614  normal  0.499823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1868  phosphogluconate dehydratase  57.28 
 
 		 613 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0660  phosphogluconate dehydratase  61.18 
 
 		 618 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2239  phosphogluconate dehydratase  56.46 
 
 		 608 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0583467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2149  phosphogluconate dehydratase  57.4 
 
 		 608 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00662337  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2632  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7067  phosphogluconate dehydratase  55.68 
 
 		 610 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1048  phosphogluconate dehydratase  57.5 
 
 		 608 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1955  phosphogluconate dehydratase  60.56 
 
 		 600 aa  704    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80923  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3442  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1810  phosphogluconate dehydratase  56.79 
 
 		 608 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4214  phosphogluconate dehydratase  57.17 
 
 		 608 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3958  phosphogluconate dehydratase  57.38 
 
 		 607 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1769  phosphogluconate dehydratase  56.74 
 
 		 601 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.618197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2177  phosphogluconate dehydratase  56.46 
 
 		 608 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.318983  hitchhiker  0.00331575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1830  phosphogluconate dehydratase  58.42 
 
 		 606 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.511602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1271  phosphogluconate dehydratase  55.09 
 
 		 600 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2793  phosphogluconate dehydratase  76.01 
 
 		 617 aa  924    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.601068  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0298  phosphogluconate dehydratase  57.05 
 
 		 606 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2986  phosphogluconate dehydratase  72.01 
 
 		 613 aa  878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65391  normal  0.0634234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1009  phosphogluconate dehydratase  57.66 
 
 		 608 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.241046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1080  phosphogluconate dehydratase  56.51 
 
 		 604 aa  685    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00217258  hitchhiker  0.0000000267621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2049  phosphogluconate dehydratase  77.65 
 
 		 605 aa  933    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0575852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0363  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2570  phosphogluconate dehydratase  67.49 
 
 		 593 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0376313  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2580  phosphogluconate dehydratase  58.98 
 
 		 637 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.226359  hitchhiker  0.00000539893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2919  phosphogluconate dehydratase  68.57 
 
 		 614 aa  829    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2046  phosphogluconate dehydratase  57.4 
 
 		 608 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.26142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1221  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 617 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>