More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3992 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3992  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.985072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  41.59 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  39.23 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  38.66 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  34.04 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.81 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  37.14 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2059  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.48 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
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