More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3037 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3037  shikimate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314744  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  40.82 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2813  shikimate 5-dehydrogenase  46.79 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  41.06 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1234  shikimate 5-dehydrogenase  41.95 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2671  shikimate 5-dehydrogenase  42.7 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3384  shikimate 5-dehydrogenase  46.1 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3450  shikimate 5-dehydrogenase  41.91 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4263  shikimate 5-dehydrogenase  40.82 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43866  normal  0.585644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2895  shikimate 5-dehydrogenase  41.2 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0777149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  35.07 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0022  shikimate dehydrogenase  36.13 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  32.25 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1989  shikimate 5-dehydrogenase  42.35 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2069  shikimate 5-dehydrogenase  42.02 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3937  shikimate 5-dehydrogenase  39.33 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1809  shikimate dehydrogenase  42.58 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  34.33 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  38.49 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2746  shikimate 5-dehydrogenase  37.18 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0290691  normal  0.306598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4285  shikimate 5-dehydrogenase  47.01 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0196  shikimate 5-dehydrogenase  41.67 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  34.33 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  33.96 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1767  shikimate 5-dehydrogenase  44.4 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  40.75 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2537  shikimate 5-dehydrogenase  41.47 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1819  shikimate 5-dehydrogenase  43.87 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.244145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  40.94 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1489  shikimate 5-dehydrogenase  43.61 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  41.82 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2675  shikimate 5-dehydrogenase  38.77 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1302  shikimate 5-dehydrogenase  41.47 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4803  shikimate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742777  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1109  shikimate 5-dehydrogenase  40.7 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  32.46 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3211  shikimate 5-dehydrogenase  38.64 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21871  shikimate 5-dehydrogenase  32.86 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2977  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.15 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3919  shikimate 5-dehydrogenase  40.47 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1489  shikimate 5-dehydrogenase  45.11 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.06753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  40.77 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  40.77 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2976  shikimate dehydrogenase  41.15 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18961  shikimate 5-dehydrogenase  30.71 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  32.82 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  39.86 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0004  shikimate 5-dehydrogenase  38.58 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0043  shikimate 5-dehydrogenase  36.6 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000585691  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1829  shikimate 5-dehydrogenase  38.17 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0037  shikimate 5-dehydrogenase  37.12 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234984  hitchhiker  0.000719905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4117  shikimate 5-dehydrogenase  41.02 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0040  shikimate 5-dehydrogenase  35.11 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3695  shikimate 5-dehydrogenase  39.62 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0130  shikimate 5-dehydrogenase  39.62 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.676056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0613  shikimate 5-dehydrogenase  39.62 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0581  shikimate 5-dehydrogenase  39.62 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0035  shikimate 5-dehydrogenase  36.23 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.265435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1275  shikimate 5-dehydrogenase  42.16 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1314  shikimate 5-dehydrogenase  31.79 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0035  shikimate 5-dehydrogenase  34.85 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2304  shikimate 5-dehydrogenase  36.1 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2772  shikimate 5-dehydrogenase  38.49 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1271  shikimate 5-dehydrogenase  43.97 
 
 		 360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.945829  normal  0.49023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  34.88 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  34.88 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18411  shikimate / quinate 5-dehydrogenase  30.5 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.611208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  35.42 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  36.36 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0538  shikimate 5-dehydrogenase  37.88 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30051  shikimate 5-dehydrogenase  34.02 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1971  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  33.57 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.84305  hitchhiker  0.000409791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0514  shikimate 5-dehydrogenase  38.11 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0006  shikimate 5-dehydrogenase  33.45 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000629471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 289 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  30.63 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3760  shikimate 5-dehydrogenase  40.3 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0040  shikimate 5-dehydrogenase  35.47 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0916944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1035  shikimate 5-dehydrogenase  42.54 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0993  shikimate 5-dehydrogenase  37.55 
 
 		 276 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0039  shikimate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 		 282 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0451521  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  36.43 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1564  shikimate 5-dehydrogenase  39.02 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0040  shikimate 5-dehydrogenase  35 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0102694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0032  shikimate 5-dehydrogenase  35.85 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00424938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2504  shikimate dehydrogenase  37.6 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0414  shikimate 5-dehydrogenase  37.45 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>