More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1951 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  59.67 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  61.92 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  49.14 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  41.18 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  42.6 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.49 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  34.06 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.15 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  29.69 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5944  transcriptional regulator, IclR family  27.11 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2809  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.67 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  26.42 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.17 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.13 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  33.93 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.12 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  31.65 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0897  regulatory proteins, IclR  32.22 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.61 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21340  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.11 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.26 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>