168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4472 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4472  epimerase  100 
 
 		 280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850637  normal  0.043776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1572  hypothetical protein  51.13 
 
 		 271 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.81 
 
 		 274 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000732935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 		 274 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0351  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.88 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1936  hypothetical protein  50.94 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 		 278 aa  251  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.327055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.67 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  46.3 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5684  epimerase  37.32 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00786287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.43 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.445491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0205  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.82 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.392426  normal  0.667561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3626  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.7 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.4 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1363  hypothetical protein  34.2 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2013  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.286143  hitchhiker  0.00478642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2861  hypothetical protein  31.56 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  hitchhiker  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04745  hypothetical protein  37.45 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1572  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000072025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2426  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.71 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3076  hypothetical protein  32.71 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4059  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.57 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.847272  hitchhiker  0.0000000181781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01919  predicted epimerase, with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.277787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2950  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.305059  hitchhiker  0.000000000138327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2154  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1043  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1692  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  unclonable  0.00000137233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2297  protein YeeZ  32.21 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0636036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2194  protein YeeZ  32.21 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2407  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  normal  0.010402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2248  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.80212  normal  0.152174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2295  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0261923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03633  hypothetical enzyme of sugar metabolism  30.86 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0904  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01848  hypothetical protein  29.71 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1301  hypothetical protein  26.91 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003834  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.51 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1973  hypothetical protein  27.64 
 
 		 231 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.39 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.44 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.64 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  26.35 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  32.45 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0985  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.7 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  31.44 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  24.79 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2278  hypothetical protein  27.31 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2036  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.1 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>