147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1926 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1926  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000171053  normal  0.0881723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0635  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 		 370 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02360  oxidoreductase  39.84 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.561743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 462 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  26.46 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  23.67 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  23.6 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  24.03 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  23.98 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  24.6 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  22.54 
 
 		 463 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  20.83 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  24.68 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 470 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  24.04 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  22.19 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  24.04 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  22.71 
 
 		 463 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  22.49 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  22.66 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  21.5 
 
 		 1033 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  24.62 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 472 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  21.64 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 468 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 468 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  23.5 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  23.84 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2757  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.83 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  23.15 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 475 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.51 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  21.29 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  25 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  21.37 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  23.46 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 477 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 464 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 443 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  55.88 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  23.33 
 
 		 470 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 		 442 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 443 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  22.44 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  28.8 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  21.3 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>