More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1084 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  100 
 
 
478 aa  936    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  44.55 
 
 
452 aa  361  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  32.75 
 
 
464 aa  200  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  32.94 
 
 
394 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1055  major facilitator transporter  32.74 
 
 
433 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.367509  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  31.07 
 
 
455 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  29.31 
 
 
449 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
405 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 
449 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  29.82 
 
 
449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
449 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  27.66 
 
 
454 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  27.66 
 
 
454 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  30.65 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  28.68 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  30.28 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  27.44 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
426 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.09 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  28.27 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  28.87 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  26.29 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.54 
 
 
406 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.36 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  30.43 
 
 
444 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  27 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.51 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.51 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.51 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.51 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29 
 
 
408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  27.95 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  30.77 
 
 
407 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.44 
 
 
406 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.99 
 
 
406 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
416 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.22 
 
 
406 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
408 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
465 aa  123  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  28.36 
 
 
449 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  27.54 
 
 
407 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
452 aa  123  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  29.68 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  29.5 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.47 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  25.67 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.47 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  28.15 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.47 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
439 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  27.99 
 
 
461 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  29.27 
 
 
439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
453 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  27.91 
 
 
446 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  27.47 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  27.98 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
446 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  28.39 
 
 
436 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  25.77 
 
 
441 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  27.76 
 
 
433 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  26.45 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  30.03 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  27.29 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  26.04 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  31.25 
 
 
460 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
472 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  31.25 
 
 
460 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  31.25 
 
 
460 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  29.38 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  29.38 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  26.34 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  29.38 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  31.14 
 
 
409 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  27.02 
 
 
444 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  28.17 
 
 
439 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  27.08 
 
 
430 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
438 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.59 
 
 
433 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  25.87 
 
 
467 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  30.84 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
443 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  29.02 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  27.84 
 
 
441 aa  113  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  30.97 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  28.5 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>