More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0444 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  51.6 
 
 		 741 aa  737    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 750 aa  1546    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  33.29 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  31.55 
 
 		 783 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  31.18 
 
 		 804 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 		 795 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 781 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  29.56 
 
 		 791 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 1027 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  28.67 
 
 		 762 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  26.25 
 
 		 750 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.18 
 
 		 801 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  37.53 
 
 		 729 aa  201  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 		 775 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 811 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.98 
 
 		 729 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  29.11 
 
 		 741 aa  190  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  28.22 
 
 		 726 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  28.73 
 
 		 737 aa  177  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.59 
 
 		 917 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.65 
 
 		 744 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.44 
 
 		 736 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 764 aa  157  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.82 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  27.19 
 
 		 888 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  30.4 
 
 		 823 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  26.75 
 
 		 888 aa  127  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  27.55 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  28.42 
 
 		 860 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  27.36 
 
 		 854 aa  124  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  27.19 
 
 		 888 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  24.63 
 
 		 899 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  27.79 
 
 		 929 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  26.96 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  26.73 
 
 		 912 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  26.32 
 
 		 892 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  27.39 
 
 		 912 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  28.49 
 
 		 907 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  26.68 
 
 		 899 aa  108  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  28.21 
 
 		 832 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  25.37 
 
 		 901 aa  108  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  26.99 
 
 		 887 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.33 
 
 		 885 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.12 
 
 		 836 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  25.05 
 
 		 944 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  26.92 
 
 		 822 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  27.19 
 
 		 860 aa  102  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  24.84 
 
 		 854 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  28.28 
 
 		 566 aa  102  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  28.37 
 
 		 827 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 594 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.13 
 
 		 944 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  26.93 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  26.63 
 
 		 906 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  28.95 
 
 		 904 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.73 
 
 		 927 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 921 aa  98.6  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.41 
 
 		 733 aa  98.2  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  27.04 
 
 		 905 aa  98.2  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  24.73 
 
 		 807 aa  98.2  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  25.69 
 
 		 933 aa  97.8  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26 
 
 		 724 aa  97.4  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 		 948 aa  97.4  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.49 
 
 		 920 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.31 
 
 		 962 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  25.99 
 
 		 879 aa  96.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  24.94 
 
 		 850 aa  95.5  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.42 
 
 		 892 aa  94.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  23.59 
 
 		 821 aa  94.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.54 
 
 		 971 aa  94.4  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.52 
 
 		 837 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  25.27 
 
 		 922 aa  92.4  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  27.7 
 
 		 897 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  27.05 
 
 		 778 aa  90.9  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 887 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  23.5 
 
 		 778 aa  89.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.22 
 
 		 897 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  26.08 
 
 		 908 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  27.78 
 
 		 651 aa  89.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 871 aa  88.2  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.19 
 
 		 820 aa  88.2  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  24.19 
 
 		 887 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  26.8 
 
 		 897 aa  87.4  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  27.52 
 
 		 899 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  24.25 
 
 		 740 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 		 829 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  27.45 
 
 		 885 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.93 
 
 		 825 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.66 
 
 		 1540 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.78 
 
 		 970 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  25.55 
 
 		 721 aa  84.7  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 899 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  23.58 
 
 		 777 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.59 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  24.54 
 
 		 919 aa  84  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 		 728 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  26.3 
 
 		 908 aa  84  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>