139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0237 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  100 
 
 		 415 aa  839    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  63.2 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  62.86 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  61.74 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  61.93 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  60.96 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  41.45 
 
 		 418 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  40.48 
 
 		 421 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  40.1 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  38.4 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  39.03 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  36.1 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  35.35 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  37.47 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  37.84 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  36.03 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  36.17 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 		 390 aa  200  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.96 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  36.02 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  34.79 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  37.74 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  33.42 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.94 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.46 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  33.16 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  32.6 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  31.53 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.66 
 
 		 431 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.02 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  33.01 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.79 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  28.86 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.22 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.43 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  29.51 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.68 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  25.68 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  28.94 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  33.12 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  27.53 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.72 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.65 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  29.8 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  28.42 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  31.17 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.1 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.91 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.29 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  30.03 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  78.43 
 
 		 141 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.29 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  33.55 
 
 		 152 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.71 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  24.59 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.68 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.74 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  24.36 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  23.73 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  26.43 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  23.36 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.61 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  23.77 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.51 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  38.1 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  30.47 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  24.04 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.63 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  21.84 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.78 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  27.23 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  22.43 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.63 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  24.77 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  30.12 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.86 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.92 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.54 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  27.75 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  29.92 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  25.6 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.77 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  26.2 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.22 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.68 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.97 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  33.06 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  23.41 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  28.5 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>