238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2440 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 223 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  34.96 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  31.7 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  30.91 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  29.82 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.81 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  31.9 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.35 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  31.53 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  31.84 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.44 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  20.72 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  27.6 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  32.46 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  31.25 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  29.49 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  47.14 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  29.13 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  38.26 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  44 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  30.94 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.76 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.53 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  32.88 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  25.45 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.45 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  29.83 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.52 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  23.73 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 294 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3719  domain of unknown function DUF1731  50.75 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.15 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  33.54 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  50.75 
 
 		 298 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  50.72 
 
 		 299 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  23.64 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  27.93 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.65 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 298 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  24.89 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  29.24 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  39.02 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.03 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  31.4 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  28.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  38.81 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  29.95 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.21 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  22.27 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  22.73 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  25.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  26.67 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.86 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3579  hypothetical protein  52.24 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.79 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  41.79 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  27.6 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  25.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  28.19 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>