More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 456 aa  905    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  47.28 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.94 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.09 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.26 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.31 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.34 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  28.34 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.8 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.17 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.7 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.7 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.06 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.29 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.52 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.95 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.32 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.74 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  23.67 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  23.67 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 451 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  22.97 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.94 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.06 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  23.89 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.77 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  21.65 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  22.3 
 
 		 456 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  23.95 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  22.28 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.87 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  25.77 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  24.82 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  21.79 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.43 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 485 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  22.76 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  23.78 
 
 		 496 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.57 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.08 
 
 		 437 aa  101  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  23.62 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.83 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  20.05 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.06 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>