245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1663 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  100 
 
 		 332 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0549  ROK family protein  33.54 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  31.12 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  31.52 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  31.52 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  31.52 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  31.82 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  31.21 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  31.21 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  31.44 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  29.57 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3453  ROK family protein  25.56 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  24.8 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  23.68 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2545  ROK family protein  27.05 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000020299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.7 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.27 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.11 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  24.78 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0688  ROK family protein  29.93 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  25.11 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  25 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  25.51 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  23.9 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  26.45 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.21 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  25.72 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  23.48 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  23.27 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  25.66 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.72 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.95 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  22.73 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0417  transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  25.71 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  23.28 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.42 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  23.33 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  26.87 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  22.73 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.54 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  22.04 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  22.22 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  24.14 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  23.71 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.32 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  23.14 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.69 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  22.92 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  22.19 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  24.19 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.4 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  23.77 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  23.55 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  22.32 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  24.05 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.59 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  25.64 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.35 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.71 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.81 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  23.6 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  21.03 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  24.49 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  23.64 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  22.63 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  24.62 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.59 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  23.77 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.1 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.21 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  23.99 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  25.61 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  23.29 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.51 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  21.52 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  25.54 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  25.9 
 
 		 410 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  26.82 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.13 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  21.61 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  25.87 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  21.69 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  25.32 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>