More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0024 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  76.08 
 
 		 540 aa  833    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 533 aa  1085    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 		 567 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2102  AAA ATPase central domain protein  29.73 
 
 		 584 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1329  AAA family ATPase  26.99 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000361614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.65 
 
 		 759 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5083  AAA ATPase central domain protein  26.42 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322132  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.85 
 
 		 718 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.47 
 
 		 760 aa  167  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.61 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.45 
 
 		 731 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.51 
 
 		 731 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.07 
 
 		 723 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.87 
 
 		 727 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.83 
 
 		 731 aa  161  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.04 
 
 		 768 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.37 
 
 		 735 aa  158  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.73 
 
 		 739 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.54 
 
 		 732 aa  156  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.51 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.54 
 
 		 704 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.15 
 
 		 808 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.4 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.79 
 
 		 737 aa  153  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.13 
 
 		 769 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  27.33 
 
 		 754 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.96 
 
 		 721 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.47 
 
 		 781 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.06 
 
 		 736 aa  151  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.13 
 
 		 719 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.13 
 
 		 754 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.58 
 
 		 730 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.35 
 
 		 754 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.95 
 
 		 737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.69 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  27.1 
 
 		 722 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.04 
 
 		 806 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3140  ATPase central domain-containing protein  22.84 
 
 		 617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  33.73 
 
 		 775 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  28.11 
 
 		 721 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.27 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.28 
 
 		 784 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.4 
 
 		 738 aa  148  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.29 
 
 		 736 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.67 
 
 		 740 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  26.77 
 
 		 703 aa  146  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1124 aa  146  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.53 
 
 		 742 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.29 
 
 		 800 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  29.34 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.91 
 
 		 757 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  28.77 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.6 
 
 		 754 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.59 
 
 		 756 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.92 
 
 		 738 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  37.22 
 
 		 764 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  27.79 
 
 		 747 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.91 
 
 		 757 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2464  ATPase central domain-containing protein  22.62 
 
 		 616 aa  144  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.67 
 
 		 743 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.97 
 
 		 740 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.74 
 
 		 773 aa  143  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.59 
 
 		 757 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 810 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  28.17 
 
 		 703 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.14 
 
 		 755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  27.22 
 
 		 713 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.69 
 
 		 804 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.56 
 
 		 738 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  25.56 
 
 		 732 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  36.1 
 
 		 763 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  32.28 
 
 		 691 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.05 
 
 		 742 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.61 
 
 		 852 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.84 
 
 		 701 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.96 
 
 		 805 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  31.9 
 
 		 832 aa  136  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  33.96 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.49 
 
 		 805 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  34.87 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  35.27 
 
 		 756 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  29.87 
 
 		 734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  36.65 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  26.46 
 
 		 749 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.81 
 
 		 739 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  28.53 
 
 		 728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 810 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  33.86 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.87 
 
 		 426 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  36.04 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.6 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.98 
 
 		 696 aa  134  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 		 464 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  29.17 
 
 		 741 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  29.17 
 
 		 741 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  29.17 
 
 		 741 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.37 
 
 		 801 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  35.86 
 
 		 407 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  33.46 
 
 		 407 aa  133  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  29.44 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>