63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4693 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  100 
 
 
264 aa  542  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  43.75 
 
 
261 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  37.92 
 
 
264 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  36.71 
 
 
237 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  33.61 
 
 
255 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  37.28 
 
 
259 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  33.76 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  40 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  34.18 
 
 
266 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  35.04 
 
 
273 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  35.96 
 
 
259 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  32.37 
 
 
240 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  36.8 
 
 
230 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  34.91 
 
 
251 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  31.38 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  33.76 
 
 
283 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  36.12 
 
 
264 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  31.36 
 
 
259 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  34.2 
 
 
255 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  31.2 
 
 
256 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  31.23 
 
 
264 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  28.74 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  29.66 
 
 
258 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.67 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.05 
 
 
461 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  27.23 
 
 
241 aa  92  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  29.13 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  30.77 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  30 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  25.96 
 
 
239 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.35 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  28.63 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  30.25 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  26.91 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  30.25 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  30.25 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  30.33 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  27.64 
 
 
233 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  26.01 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  26.46 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.9 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.72 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  23.87 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  27.27 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  28.63 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  31.12 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  25.41 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  30.94 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  26.92 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  26.92 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  26.44 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  24.64 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.79 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.42 
 
 
245 aa  58.9  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  27.14 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.29 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.07 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  28.32 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  25.75 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  23.53 
 
 
264 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  26.8 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  24.4 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>