200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4676 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  333  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  42.95 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  42.24 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  41.26 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.47 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  39.88 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  37.5 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  39.52 
 
 		 175 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  40.94 
 
 		 320 aa  94.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  40.74 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  37.3 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.87 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  34.03 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  40.74 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  41.33 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  36.57 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.57 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  37.86 
 
 		 302 aa  88.2  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  40.65 
 
 		 318 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  38.41 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  41.01 
 
 		 323 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  44.34 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  47.25 
 
 		 203 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.16 
 
 		 365 aa  84  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.88 
 
 		 342 aa  84  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  41.73 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  46.15 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  40.83 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  35.16 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.84 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  41.88 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  31.74 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  37.68 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.16 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  40.4 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  37.41 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  34.27 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  36.89 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.98 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  38.05 
 
 		 429 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  37.09 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  37.75 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  34.09 
 
 		 351 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  34.44 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  34.09 
 
 		 334 aa  74.7  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  34.44 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  35.66 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  37.19 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  36.52 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  36.52 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36.62 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  42.72 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.6 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  38.32 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  37.37 
 
 		 337 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.61 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  37.23 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  33.1 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  37.31 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.51 
 
 		 328 aa  70.5  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.37 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  39.18 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  33.91 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  38.14 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.61 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.17 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  38.14 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  36.13 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0924  protein of unknown function DUF461  38.84 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  30.67 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  34.33 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>