More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3253 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3253  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  884    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.78 
 
 		 454 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  29.49 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  29.89 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  25.96 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  29.7 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 454 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25.31 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  27.46 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  29.68 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  29.68 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  27.73 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  27.01 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.45 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  28.03 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  29.64 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  30.13 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  25.45 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  31.27 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  28.1 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  28.97 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  30.4 
 
 		 462 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 477 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  24.88 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  31.15 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  28.81 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  31.37 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  29.24 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  25.83 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  27.86 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  28.79 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  25.57 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  25.36 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.93 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  27.27 
 
 		 457 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  27.27 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  27.61 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4911  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  27.27 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  27.03 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  30.33 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  29.74 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  24.88 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  26.48 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  27.39 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2633  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0913646  normal  0.0762555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.74 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  25.81 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  26.24 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  25.81 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>