More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1882 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1882  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0607  IclR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171658  normal  0.119354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51205  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00609601  hitchhiker  0.00000763207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4370  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1226  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  24.17 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.76 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  23.95 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.13 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.04 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.5 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.5 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.41 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.5 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.23 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.77 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  24.65 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  23.93 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.04 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  20.8 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  26.79 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.2 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.51 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.21 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  25.66 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  23.56 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.64 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  23.98 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  23.64 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>