More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1079 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1079  CBS sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 512 aa  1009    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.721589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  27.59 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.15 
 
 		 631 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 772 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 877 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 873 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  32.09 
 
 		 900 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 876 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.64 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 		 1222 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 		 969 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1350 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 873 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 644 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 687 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 944 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 837 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 627 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  31.19 
 
 		 651 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 717 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 903 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 863 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 1055 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 554 aa  130  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1226 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 864 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 863 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  30.55 
 
 		 651 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 633 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.08 
 
 		 763 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 850 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.32 
 
 		 645 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 643 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  29.18 
 
 		 793 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 643 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1143 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 764 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  30.16 
 
 		 641 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  27.15 
 
 		 968 aa  126  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 895 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  26.23 
 
 		 732 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 643 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1407 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 847 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  25 
 
 		 576 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 		 1204 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  25.65 
 
 		 758 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 1027 aa  123  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1135 aa  123  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 623 aa  123  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 871 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  28.84 
 
 		 802 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 879 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  29.49 
 
 		 1125 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  28.96 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 631 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  26.55 
 
 		 984 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.49 
 
 		 738 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  34.69 
 
 		 786 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  28.18 
 
 		 742 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 846 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 		 959 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  27.07 
 
 		 733 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 803 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.49 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 643 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 		 603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 690 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  28.65 
 
 		 659 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 		 785 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  26.05 
 
 		 857 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.27 
 
 		 1535 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 860 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  28.88 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 866 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 		 1324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  29.79 
 
 		 826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 913 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 641 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 982 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1070 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  28.95 
 
 		 1060 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  29.53 
 
 		 795 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1125 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 902 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 880 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  31.7 
 
 		 945 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  26.09 
 
 		 736 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 947 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 614 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 1068 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>