More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0688 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  69.96 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  68.55 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  67.84 
 
 		 293 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  66.43 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.14 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.6 
 
 		 289 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.72 
 
 		 284 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.43 
 
 		 284 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  67.53 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.28 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.68 
 
 		 290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  64.21 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 		 273 aa  334  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  60.89 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.17 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 		 284 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  59.78 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  56.99 
 
 		 282 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  61.99 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  61.37 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  56.57 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  56.51 
 
 		 269 aa  311  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  56.51 
 
 		 269 aa  311  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  56.41 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  55.31 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  55.2 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  56.58 
 
 		 284 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  54.84 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  54.84 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  54.45 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56.09 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  56.23 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  54.35 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  53.14 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 296 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.31 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.44 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.12 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.24 
 
 		 238 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.29 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.31 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 247 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  31.05 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.01 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  29.55 
 
 		 250 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.96 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.52 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.1 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.1 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.1 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.1 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 		 347 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>