More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1883 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  54.39 
 
 
667 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  52.73 
 
 
663 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  52.73 
 
 
663 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  54.39 
 
 
667 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  55.93 
 
 
666 aa  730    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  55.93 
 
 
666 aa  730    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  53.68 
 
 
668 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  52.12 
 
 
665 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.08 
 
 
662 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  52.56 
 
 
670 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  52.56 
 
 
670 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  56.83 
 
 
688 aa  758    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  53.24 
 
 
675 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.43 
 
 
664 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  56.33 
 
 
666 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.76 
 
 
690 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  52.27 
 
 
661 aa  685    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  50.6 
 
 
666 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  50.68 
 
 
664 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  52.5 
 
 
665 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  51.11 
 
 
674 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  56.33 
 
 
666 aa  777    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  52.03 
 
 
664 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  56.17 
 
 
666 aa  777    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  51.43 
 
 
664 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  56.33 
 
 
666 aa  778    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.76 
 
 
690 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  52.73 
 
 
668 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  52.66 
 
 
668 aa  677    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  52.19 
 
 
665 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  51.75 
 
 
665 aa  658    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  52.56 
 
 
668 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  53.38 
 
 
690 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  52.92 
 
 
707 aa  678    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50.15 
 
 
670 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  53.19 
 
 
677 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  52.81 
 
 
661 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.49 
 
 
670 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.76 
 
 
690 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  51.13 
 
 
665 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.52 
 
 
681 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  55.11 
 
 
664 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  52.41 
 
 
690 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  55.22 
 
 
684 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.81 
 
 
669 aa  692    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.77 
 
 
669 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  53.53 
 
 
678 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.12 
 
 
668 aa  687    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  49.77 
 
 
662 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  51.11 
 
 
674 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  56.33 
 
 
666 aa  777    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.67 
 
 
668 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.41 
 
 
668 aa  705    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  51.89 
 
 
671 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  51.16 
 
 
707 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  54.25 
 
 
682 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  52.06 
 
 
690 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  53.09 
 
 
671 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.95 
 
 
670 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.53 
 
 
669 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  51.51 
 
 
693 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.34 
 
 
667 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.57 
 
 
673 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  52.64 
 
 
663 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  55.15 
 
 
664 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  52.42 
 
 
674 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.97 
 
 
668 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  51.54 
 
 
694 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  54.26 
 
 
680 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  50.76 
 
 
664 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.71 
 
 
671 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  51.82 
 
 
681 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.81 
 
 
663 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  51.9 
 
 
665 aa  658    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  51.86 
 
 
684 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  53.44 
 
 
659 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  51.06 
 
 
665 aa  661    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.61 
 
 
697 aa  740    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  57.92 
 
 
667 aa  736    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  52.7 
 
 
690 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  58.48 
 
 
691 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.15 
 
 
666 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  52.41 
 
 
662 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.26 
 
 
672 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.68 
 
 
664 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  50.83 
 
 
664 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  49.4 
 
 
667 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  50.84 
 
 
666 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.6 
 
 
670 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  52.85 
 
 
690 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.12 
 
 
665 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.29 
 
 
658 aa  654    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.67 
 
 
658 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  52.7 
 
 
690 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  58.48 
 
 
691 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  53.89 
 
 
655 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.83 
 
 
664 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  53.19 
 
 
692 aa  679    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  54.14 
 
 
668 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  54.04 
 
 
671 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>