More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0507 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 362 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  54.93 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  53.24 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  50.42 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  44.82 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  45.18 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  45.03 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.92 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  45.68 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.86 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  42.18 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.53 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 		 386 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  41.67 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.9 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.06 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.3 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  41.07 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.3 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  38.93 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.66 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.38 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  38.42 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.26 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  38.04 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.92 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 389 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  40.77 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.25 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  45.61 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 379 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.63 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.71 
 
 		 389 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.81 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.95 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.9 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  39.72 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.33 
 
 		 358 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  43.9 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.96 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  39.82 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  38.35 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 422 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.71 
 
 		 337 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.22 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  40.11 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.21 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  47.6 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  45.04 
 
 		 422 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.16 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.8 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  39.88 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.62 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  44.84 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  43.97 
 
 		 475 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  46.9 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  40.58 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.62 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  37.46 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  38.6 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>