244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0176 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  52.79 
 
 		 725 aa  813    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1525    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  60.16 
 
 		 734 aa  902    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  55.83 
 
 		 743 aa  868    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  54.21 
 
 		 730 aa  824    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  47.18 
 
 		 722 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  47.79 
 
 		 761 aa  722    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  26.3 
 
 		 803 aa  177  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  21.97 
 
 		 780 aa  121  6e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  23.93 
 
 		 766 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  21.41 
 
 		 809 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 810 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  21.13 
 
 		 875 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  23.73 
 
 		 808 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  35.53 
 
 		 853 aa  94.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  21.6 
 
 		 610 aa  94.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  30.2 
 
 		 745 aa  92  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  23.45 
 
 		 769 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  22.63 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  33.63 
 
 		 858 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  22.32 
 
 		 772 aa  85.1  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  22.91 
 
 		 811 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  31.16 
 
 		 851 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  29.25 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  32.3 
 
 		 622 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  21.04 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  33.53 
 
 		 835 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  31.06 
 
 		 622 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.98 
 
 		 888 aa  71.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  22.44 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 1002 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  32.32 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  32.32 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  32.32 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.94 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  22.98 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  30.99 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  29.19 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.4 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  36.67 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.45 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.41 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  32.24 
 
 		 683 aa  60.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  30.46 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  34.45 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  34.45 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  33.1 
 
 		 588 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 595 aa  59.7  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.58 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  33.88 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.67 
 
 		 848 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  37.84 
 
 		 765 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  27.32 
 
 		 891 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  31.39 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  28.63 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  31.06 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  31.47 
 
 		 776 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  24.73 
 
 		 763 aa  55.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  29.78 
 
 		 611 aa  55.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  31.06 
 
 		 618 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  20.74 
 
 		 673 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 661 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.36 
 
 		 790 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 661 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.57 
 
 		 787 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  31.39 
 
 		 583 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.57 
 
 		 787 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  31.93 
 
 		 598 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  23.63 
 
 		 794 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  31.39 
 
 		 583 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  22.38 
 
 		 796 aa  54.7  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  30.83 
 
 		 653 aa  54.3  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.96 
 
 		 786 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 643 aa  54.3  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.49 
 
 		 799 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  22.92 
 
 		 796 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.57 
 
 		 769 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  24.3 
 
 		 627 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30 
 
 		 770 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.22 
 
 		 769 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.94 
 
 		 765 aa  53.5  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 583 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  35.45 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  22.15 
 
 		 844 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.13 
 
 		 779 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  32.35 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.6 
 
 		 892 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  30.26 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  36.94 
 
 		 765 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 786 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  31.29 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 661 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  29.14 
 
 		 627 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 582 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  32.35 
 
 		 578 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 999 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 		 797 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>